Il Center for Cultural Heritage Technology (CCHT) mira a ricercare e promuovere nuove tecnologie per l'analisi e la conservazione dei beni culturali, tangibili e intangibili, ampliando e migliorando gli attuali approcci.

Il Center for Human Technologies (CHT) ha lo scopo di sviluppare tecnologie per la salute umana, la riabilitazione e l'interazione uomo-macchina.

Il Center for Life Nano- & Neuro-Science (CLNS) svolge le proprie attività attorno a tematiche di interesse biomedico dove l’innovazione tecnologica è la chiave per raggiungere gli obbiettivi: i disordini neurodegenerativi e i tumori cerebrali.

Il Center for Materials Interfaces (CMI) è dedicato allo studio, lo sviluppo, alla caratterizzazione, e allo sfruttamento di materiali allo nanoscala, con un'attenzione particolare per gli effetti all'interfaccia.

Il Center for Neuroscience and Cognitive Systems (CNCS) si concentra su un approccio multidisciplinare per comprendere le capacità di calcolo del cervello. 

Il Center for Nanotechnology Innovation (CNI) è un centro di R&D interdisciplinare che si dedica allo studio e la valorizzazione dei fenomeni osservati alla nanoscala.

Il Center for Advanced Biomaterials for Healthcare (CABHC) sviluppa materiali e tecnologie per ispirate a sistemi biologici per applicazioni biomediche.

Il Center for Synaptic Neuroscience and Technology (NSYN) applica un approccio multidisciplinare allo studio delle funzioni cerebrali e alle patologie correlate. Lo scopo è sviluppare tecnologie innovative applicabili nell'ambito delle neuroscienze.

Il Center for Biomolecular Nanotechnologies (CBN) si occupa dello sviluppo di materiali biomolecolari e biologici e delle loro interazioni alla nanoscala.

Il Center for Convergent Technologies (CCT) è la più grande infrastruttura di ricerca all'interno del network dell'Istituto. E' la sede dove, nel 2006, ha avuto inizio il progetto della Fondazione. 

Il Center for Genomic Science (CGS) applica moderne tecnologie genomiche per una migliore comprensione dei processi biologici complessi e delle patologie, con particolare attenzione alle neoplasie.

Il Center for Nano Science and Technology (CNST) ha come missione “l’innovazione” attraverso la scienza e la tecnologia a livello nanometrico. L’obbiettivo è di trasferire nuove conoscenze di base in nuove applicazioni, dalle bio-interfacce all’energia.

Il Center for Robotics and Intelligent Systems (CRIS) èil centro genovese di IIT dedicato alla robotica. La struttura permette sperimentazioni robotiche in spazi appositamente progettati sia all'aperto che al chiuso.

Il Center for Sustainable Future Technologies (CSFT) conduce una ricerca basata sulla sostenibilità ed è inserito all'interno di un contesto scientifico-tecnologico globale fortemente improntato sulla tutela ambientale.

Il Center for Translational Neurophysiology of Speech and Communication (CTNSC) focalizza parte delle sue attività sullo studio della comunicazione perché crediamo che nel caso di molte patologie che immobilizzano il paziente, per prima cosa sia importante il ripristino della capacità di comunicare con l’ambiente circostante.